São Francisco do Conde pode ganhar uma universidade federal sede aqui no município. Atualmente a cidade tem um campus da Universidade da Integração Internacional da Lusofonia Afro-Brasileira, que tem sede em Redenção-CE. O Ministério da Educação anunciou a criação da Universidade Federal África-Brasil, s ser implantada inicialmente aqui na cidade.
As obras do prédio que estaria sendo construído para abrigar a Unilab, que ocupa uma escola da educação básica da cidade desde 2014, estão bem avançadas. A nova universidade federal no estado da Bahia pode ser um marco na educação superior na Região Metropolitana de Salvador, e portal de entrada para Recôncavo Baiano.
